はじめに

NGSのデータがあるけど、どう解析しようか困っている人はたくさんいるかもしれない。少なくともオレは困っている。グーグル先生に聞いたり論文を読んでいるふりをしたりした結果、辿り着いたことを記して、他の人の役にもたってくれたらそれはとってもうれしいなって。
対象としては、まさしくオレで
・NGSで読んだリードデータは持っている
・Rは使える
・Mac OSXを使っている(Linux、Windowも追加予定?)
・ファイル処理くらいならPythonを使える
・他の言語?なにそれおいしいの?
・もちろんJavaSQLなにそれもおいしいの?
・学部後半〜修士レベルの生物系学生
情報科学的な能力で言うとたぶんダメダメな子
・特にメチル化解析をしようと考えている人