2011-01-01から1年間の記事一覧

Rで積分その2

こちらの続き。 データはこちらから。 曲線で囲まれる斜線部の面積を求めてみる。 という関数なので、与えられた濃度で積分してみる。 ただし、x軸は常用対数であることに注意して conc<- c(0.01,0.03,0.1, 0.3,1, 3,10, 30,100,300,1000) resp<- c(1,1,1,7,…

Rで積分

積分したい。 を例にとって考えてみる。 以下、は積分定数。、x軸、x=1で囲まれる面積 、y軸、y=1で囲まれる面積 とすると Rでやってみる。 integrate f<- function(x){ return(x^2) } integrate(f,0,1) 0.3333333 with absolute error < 3.7e-15

体重減少(担当EI)

55M 主訴:どんどん体重がやせる 何年も痩せようとしていたが無理だった。はじめは嬉しかったが、心配になって来院。 問診:6ヶ月で30ポンド痩せた(12kgくらい) そもそも、体重減少とは? 6~12ヶ月で5%以上の低下。らしい。 主観的な評価だけでなく、実際…

10/31 MIKUセミナー 微分演算子

同時2階定数係数線形微分方程式 について、1階微分を、2階微分をとおくと と書きかえられる。 このを微分演算子という。 また、この微分演算子の多項式を微分作用素という。 微分作用素のをとおいて代数方程式としたものを特性方程式という。 ・・・(1) 2階…

漸近線を考える

今やっていることで、用量反応曲線の漸近線の有無を評価したい。 毎度おなじみ、こちらのデータを使って漸近線について考えてみる。 用量反応曲線を書くために、R上では以下のロジスティック曲線を推定している。 微分係数が0のとき、傾きが0という高校数学…

浮腫(担当KY)

62F 主訴:2週間前からの下肢浮腫 浮腫の生理・病理として 毛細血管静水圧 間質の膠質圧 血漿膠質浸透圧Alb 間質の静水圧 血管透過性 リンパ管の閉塞 全身性(両側性に症状が現れる) 考えるべき臓器は、心臓、肝臓、腎臓 肝硬変(Alb合成不全による血管膠質…

症候学勉強会バックナンバー一覧

20110531全身倦怠感 20110608鼻血 20110615呼吸困難 20110622体重減少 20110628頭痛 20110706腹痛 20110713悪心・嘔吐 20110721疲労感 20110722貧血 20110725女性の腹痛 2011年上半期まとめ 20110909骨痛 20110913失神 20110916咳 20110920高血圧 20110927背…

感染症(担当YF)

グラム染色と形状による分類の確認。 代表的なものを挙げる。 グラム陽性 球菌 ブドウ球菌:黄色ブドウ球菌、表皮ブドウ球菌 レンサ球菌:肺炎球菌、溶血連鎖球菌 桿菌 バシラス属:炭疽菌 クロストリジウム属:破傷風菌、ボツリヌス菌、ウェルシュ菌、C.dif…

10/17 MIKUセミナー

を解くと Rで描くと f<- function(x){ return(sqrt(10-sin(x)/x)) } a<- seq(0.1,300,0.01) plot(a,f(a),cex=0.3) なので漸近線は

やる回数が増えるとp値は厳しくなる

こちらの続き。 20回の試行を増やしてみる。 10回、100回、1000回、10000回して、それぞれ8回、80回、800回、8000回表が出たとする。 つまり、点推定ではどれも0.8。 p<- 0.8 trial<- 10^(1:4) apply(cbind(trial*p,trial*(1-p)),1,binom.test,0.5) [[1]] Ex…

p値

PART4 CHAPTER15のシミュレーション。 p値と検定について。 こちらで、統計とは、 集計すること 検定すること 推定すること と書いた。 今回は検定について考える。 ここで、本中にある例を使って検定をしてみる。 例:コインを20回投げたところ、16回は表、…

胸痛(担当AM)

31M 主訴:共通を訴えて救急科に来院 鑑別は多岐に渡るので、心臓、呼吸器、消化管の分類で 鑑別 心血管系 虚血性心疾患 大動脈解離 心筋炎 心外膜炎 呼吸器 気胸 肺塞栓症 気管支炎、肺炎(たぶん主訴は咳) 胸水 腫瘍 肺高血圧 消化管 食道静脈瘤破裂 逆流…

物忘れ(担当HF)

75M 主訴:物忘れ 妻が心配し、妻に付き添われて来院 鑑別のポイントとしては、認知症かそうでないか 認知症は進行は食い止められるが、治りはしない 認知症 アルツハイマー型認知症 脳血管性認知症 レビー小体型認知症 前頭側頭型認知症 嗜銀顆粒性認知症 …

用量反応曲線から決定係数を出す

こちらの続き。 決定係数を出したかったのだが、drm関数中にはなさそうなので自作する。 n個のデータがあって、とすると :決定係数 :実測値 :回帰による推定値 :観測値の平均 より と定義されるらしい。 パラメータの数により、上の決定係数の定義は良く…

miのRモード

というのがあったのでインストールしてみる。

鼻出血(担当YM)

主訴:鼻出血 生後40日F 原因としては、鼻そのもの、出血傾向、その他 鼻そのもの キーゼルバッハ部位 骨折 出血傾向 血友病 造血系腫瘍 ITP(IIb/IIIa or Ib/IX) TTP(ADAMTS13) 免疫不全でもなるらしい vWF病 ベルナールスリエ病(GPIb/IX) 血小板無力症(GPII…

データをグラフ化する

PART3 HCAPTER7のシミュレーション。 130人の体温をシミュレーション作成してプロットしてみる。 tm<- rnorm(130,36.5,0.8) plot(rep(1,length(tm)),tm,cex=0.5,col="red",ylim=c(30,40)) par(new=TRUE) boxplot(tm,ylim=c(30,40)) par(mfrow=c(2,2)) hist(t…

9/26 MIKUセミナー

信頼区間について。 信頼区間とはなんぞや、といろいろ語る人がいるけど、理解しづらい。 という訳で、自分が何をしたいか、知りたいかを例に取りながら考えることにする。 そもそも、統計とは、という話題で、統計とは 集計すること 検定すること 推定する…

用量反応曲線 Dose Response Curve

用量反応曲線(Hill's curve?)を描くことになった。 だがしかし、グーグル先生に聞くと、いろいろ引っかかる(これとかこれ)けれども、用量反応曲線を描いた人はなかなか引っかからない。 というわけでやってみる。 実は昔やろうとして挫折していた。ここ…

(担当AY)

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背部痛(担当MO)

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高血圧(担当HA)

66F BP 170/95 鑑別 本態性高血圧 薬剤性 α刺激薬 シクロスポリン NSAIDで上がるらしい アルコール 腎性高血圧(腎前性と腎実質性) 甲状腺中毒症 副腎腫瘍 原発性アルドステロン症 クッシング症候群 褐色細胞腫 大動脈狭窄症 悪性貧血 急性腎不全 処方薬の…

咳(担当EI)

22F 咳、熱 8月 鑑別 レジオネラ肺炎 クーラー、冷房 夏風邪 肺炎 マイコプラズマ 結核 気管支炎 喘息 COPD アレルギー インフルエンザ? 副鼻腔炎 咽頭炎 喉頭炎 扁桃炎 O:咳は3日前。熱は2日前から微熱37度近辺、前日から上昇38.8度。 Q:痰がでる。黄色…

失神(担当KY)

23M medical student Main Theme What do we ask in the interview? Consciousness requires the following… Organized cortical electrical activity Glucose Oxygen A functional delivery system to deliver oxygen and glucose Differential Diagnosis A…

骨痛(担当YF)

40F。独身。 1年前から全身の骨に痛みが徐々に現れた。 やがて日常生活にも支障が出るようになった。 以降、ロキソプロフェン内服。 特に下腹部と胸部の痛みが強い。 複数の医療機関を受診後、当院受診。 Caサプリを飲んだこの1週間は症状が軽い。 1年で10kg…

ポアソン定数の信頼区間

こちらから。 poisson.conf <- function(x, conf=0.95){ N2 <- length(x)*2 df <- 2*sum(x)+2 alpha2 <- (1-conf)/2 return(qchisq(c(alpha2, 1-alpha2), df)/N2) } n<- 100 poisCI<- matrix(0,n+1,2) dimnames(poisCI)<- list(0:n,c("lower","upper")) for(…

生存曲線の信頼区間

PART2 CHAPTER5のシミュレーション。 library(survival) data<- matrix(c(4.07,6.54,1.39,6.17,5.89,4.76,3.67,1,0,1,0,1,1,0),nc=2) res<- survfit(Surv(data[,1],data[,2])~rep(1,nrow(data)),type="kaplan-meier") plot(res,frame=FALSE,xlab="time",ylab…

信頼区間

PART2 CHAPTER4のシミュレーション。 参考 箱の中に赤玉と黒玉がある。 赤玉は全体の25%である。 箱の中から玉を1つ取り出し、色を記録する。 取り出した玉はもとに戻す。 これを15回行って1セットとする。 という条件でシミュレーションを行い、各セットか…

数学いらずの医科統計学

MIKUセミナーで以下の本を使う。数学いらずの医科統計学 第2版作者: 津崎晃一出版社/メーカー: メディカルサイエンスインターナショナル発売日: 2011/03/24メディア: 単行本購入: 1人 クリック: 37回この商品を含むブログ (2件) を見るPART1 統計学入門 用語…

ミクの歌って覚える統計入門

というサイトを教えてもらった。