SPADEを昔やったけど、免疫システムの多次元データ解析という総説があって、「FCSの高次元データ、とりあえずSPADE使ってみなよ」的なことが書いてあったのだが、BioconductorのSPADEはFCSデータ専用感が満載なので、行列データが生で存在していても使えるよ…