R の関数にcolors というものがあって、これで色の名前指定でデフォルトで入っている色を使える。 プロットしているときに単純にcol=番号指定だと1:8 で終わってしまうし、かと言っていい色ないかなと毎回悩むのでとりあえず灰色以外を一括してプロットして…

推定するパラメータに順序制約があるとき、rstan ではordered、正に限定するならpositive_ordered が使える。 例えばYaegashi (J Hum Genet. 1998;43(2):85-90.)らは、出生時の染色体異常が母体年齢に応じてどう推移するかをデータを取って調べている。 ここ…

読んだ。 Cancer Inform. 2014 Jan 16;13:13-20. オミックス研究では、各染色体でのCNVや遺伝子発現状態、各種統計量の定量値や分布などをずらずらっと描きたいが、横に長く描くといけてないと誰かが思ったのだろうか、丸く描くやり方がある。 これをcircos …