COVID-19と無症候性低酸素血症

R Rpackage Rを使いこなす医学感染症学統計麻酔

書いた。 Asymptomatic Hypoxemia as a Characteristic Symptom of Coronavirus Disease: A Narrative Review of Its Pathophysiology. COVID 2022, 2(1), 47-59. COVID-19において、低酸素血症なのにぜんぜん苦しそうにない、いわゆるhappy hypoxia もしく…

2021-12-01

ランダムに昇進を決めることが全体の価値を最も高める、というPeterの法則とイグノーベル賞の話

R Rpackage Rを使いこなす数理モデル統計

読んだ。 [0907.0455] The Peter Principle Revisited: A Computational Studyこんな動画を見た。 www.youtube.com 2010年のイグノーベル賞で、Peterの法則というものをシミュレーションで示した、という話。社員地位構造が階層的な場合、昇進するときに能力…

2021-11-27

クレアチニンクリアランス

R 医学生理学薬理学

薬剤の投与量を考えるときに、クレアチニンクリアランスというものを考慮しないといけないのだが、クレアチニンクリアランスにはクレアチニンと男女と体重が必要である。そんなものは電子カルテで自動計算してくれればいいのだが、デフォルトではしてくれな…

2021-10-19

人工呼吸

麻酔医学数理モデル

読んだ。INTENSIVIST Vol.10 No.3 2018 (特集:人工呼吸器)メディカルサイエンスインターナショナルAmazonINTENSIVIST Vol.4 No.4 2012 (特集:呼吸器離脱)メディカルサイエンスインターナショナルAmazon安かったので呼吸器離脱を買っては積んでいて、某新型肺…

2021-09-26

年収○千万円は税金で半分持っていかれる、というのは本当なのか?

ここでポチポチ入力しながら遊んでいた。最新手取り給与計算機｜手取り給与に落胆！？知っておきたい手取りと額面の違い | ファンジョブ税金計算というのをほとんどやったことがない。というのは確定申告くらいはしたことあるので言い過ぎだが、かといっ…

2021-09-12

ECMO

感染症学循環器内科学医学麻酔

読んだ。ECMO・PCPSバイブルメディカ出版AmazonVVECMOが扱える高度医療人（）になれと言われて講習会なるものに強制参加させられたら、後日参加者宛に届いた。みなさんご存知の通り、新型肺炎が流行ってVVECMOの機会が増えている。自分も集中治療をやる前は…

2021-08-09

legend 内部で数式を混在させながら左揃えで2行にわたってテキストを書きたい

R Rを使いこなす数学いらずの医科統計学統計

結論から言うと、substitute 関数を使って数式を記述し、atop を分子と分母について2行にわたって記述したいテキストに対してそれぞれ使う。ただし、分数表記でいうと微妙に高さがずれるので、atop は中央の括線を書かないので気にしない、ということにすれ…

2021-08-01

懲役刑と罰金刑の関係

R 統計

※法律素人なので懲役刑もしくは罰金刑のどちらがよい/悪いを推奨しているわけではありません。実際に刑を受ける場合は弁護士に聞いてください。〇〇年の懲役または△△円の罰金、というフレーズをときたま見かけるが、法律的に一定の指標があるのかどうか気に…

2021-07-18

ICUのルーチン・エビデンス

医学麻酔

読んだ。ER・ICU 100のスタンダード中外医学社AmazonCOI：著者に知り合いがいたが買ってから気づいた。良い点：具体的な投与量や計画が載っている。大事なことは別の項目でも同じことが書いてある。悪い点：同じようなことが書いてある。血糖管理とか同じ…

2021-07-02

3連PCR

R Rを使いこなす医学感染症学統計

新型肺炎で2回PCRしたけど陰性で、でも感染症の専門家がやっぱり疑わしいからダメ押しでもう一回PCRやって、というのでやったら陽性だったと言われた。検査には感度と特異度という検査特性が存在するので、検査が陽性だからといって本当にその疾患が陽性で…

2021-06-06

Rのshiny をweb公開したときに日本語フォントが表示されないのがlibrary(showtext) で解決しなかった

R Rpackage Rを使いこなす LINUX 高度情報化

ちょっとしたアプリケーションを作って、自分以外の、Rが使えない人でもデータを入力したら出力を得られるような仕様にしたい。そこで、R のshiny を使ってweb にアクセスしたら使えるようにするわけだが、ローカル環境で構築したshiny アプリではプロット…

2021-05-11

新型肺炎の変異株で若年者は本当に重症化しやすいのか

R Rpackage Rを使いこなす rstan 医学感染症学数理モデル統計

結論から言うと、0.うんぬん%以内の増加は40-50歳代の年齢層であるようだが、それよりも80歳以上の高齢者での死亡率増加が大きく、かつ感染者数が増えており重症のままベッドを占拠しておりながらもすぐに死亡してベッドを空ける、というわけではないので、…

2021-05-02

医療裁判の判例

医学高度情報化麻酔

読んだ。医事法判例百選第2版 (別冊ジュリスト 219)発売日: 2014/03/31メディア: ムック医事法判例百選 (別冊ジュリスト (No.183))メディア: ムック医療過誤判例百選 (別冊ジュリスト (No.102))メディア: 単行本これに1989年と1976年に出た別冊ジュリスト医…

2021-05-01

Interrupted time series analysis でARIMAを使って真面目にやる

R Rpackage Rを使いこなす統計数学いらずの医科統計学

読んだ。 Interrupted time series analysis using autoregressive integrated moving average (ARIMA) models: a guide for evaluating large-scale health interventionsInterrupted time series analysis は介入の前後でlevel（増減、つまり切片）とtrend…

2021-04-29

医療事故の舞台裏

読んだ。医療事故の舞台裏―25のケースから学ぶ日常診療の心得作者:長野展久発売日: 2012/09/01メディア: 単行本COI：中古で安かったので買った。別に判例集を読んでいるが、一般的な判例集とは違い、臨床経過があって、場合によってはいくらか検査値データ…

2021-03-29

化合物の構造式を描きたい

R Rpackage Rを使いこなす毒性薬理学

という相談を受けた。化合物なんてまったく扱ってないし構造式も大学入試以来描いたことがないが、こういうのはRで出来るだろうと思って調べたらあった。 ChemmineR: a compound mining framework for R | Bioinformatics | Oxford Academic ChemmineR: Che…

2021-03-18

メタアナリシスで、サンプルサイズが最も大きいわけではないのに、weightが最大になるのはおかしくないですか?

R Rpackage Rを使いこなす数学いらずの医科統計学統計

という質問を受けた。結論から言うとおかしくない。メタアナリシスのweight は各研究内の分散と研究間の分散により（fixed model の場合）もしくは（random effect model の場合）で決まるから、分散が小さい、すなわち推定精度の高い研究はweight が大…

2021-03-07

エビデンスはあるのか、というとほとんどないに等しい

医学麻酔

読んだ。〜その麻酔管理方法にエビデンスはあるのか?〜心臓血管麻酔Positive and Negativeリスト25発売日: 2020/09/28メディア: 単行本（ソフトカバー）COI：とあるポイントが期限が迫っていたので新品で買うはめになった3000円くらいでB5版200ページもない…

2021-03-06

ACLS

医学麻酔

読んだ。というかやってきた。ACLSプロバイダーマニュアル AHAガイドライン2015 準拠作者:American Heart Association(AHA:アメリカ心臓協会)発売日: 2017/02/15メディア: 単行本（ソフトカバー）特に言うことはない。迅速挿管、という訳があったがこんな語…

2021-02-12

判別分析の判別線がおかしい

Rを使いこなす Rpackage R 数学いらずの医科統計学統計

という相談を受けた。解析したいデータは2変数なので、例として判別分析モデルの応用がついてきたが、3変数の場合はirisを用いてデータ解析・マイニングとR言語もついてきて、こんな感じでやりたい、と言われた。0/1のtype は以下の線形モデルで表現さ…

2021-01-28

Basics of Anesthesia

医学麻酔

輪読回で後半から参加して読んだ。Basics of Anesthesia作者:Pardo MD, Manuel,Miller MD MS, Ronald D.発売日: 2017/07/10メディア: ハードカバーアメリカの制度の話にはなるが、救急やICU、オペ室の運営の仕方や労働裁量の話などがあって興味深かった。