Rでメタアナリシス

R Rpackage G.E.I.2012 統計 Rを使いこなす医学

メタアナリシスの講義を受けたのでrmetaを使ってメタアナリシスがどんなんかをひたすらプロットしていく。 install.packages("rmeta") library(rmeta) data(catheter) このデータは銀加工かなんかをされたカテーテルの細菌感染具合を調べたものらしい。加工…

2012-10-30

トランスクリプトーム・プロテオーム・メタボローム・バイオマーカー・診断基準、転写・翻訳多様性

R G.E.I.2012 統計医学

ゲノム疫学のためのインフォマティクス2012 トランスクリプトーム・プロテオーム・メタボローム・バイオマーカー・診断基準、転写・翻訳多様性だったのだが、前回の進捗の都合でメタアナリシス。ケースコントロールスタディとオッズ比アレルAとアレルaの…

2012-10-22

ゲノム(2)マルチプルテスティング、メタアナリシス、シングル・セル・シークエンシング

医学統計 G.E.I.2012

ゲノム疫学のためのインフォマティクス2012 ゲノム(2)マルチプルテスティング、メタアナリシス、シングル・セル・シークエンシングマルチプルテスティング複数の検定をしている疾患Xの有無とSNPのジェノタイプとの関係の有無をGWASした複数のSNPについて…

2012-10-16

ゲノム(1)、ハプロタイプ、連鎖不平衡、因子の組合せ、アレル特異的機能差

R G.E.I.2012 Rを使いこなす医学

ゲノム疫学のためのインフォマティクス2012 ゲノム(1)、ハプロタイプ、連鎖不平衡、因子の組合せ、アレル特異的機能差 case 100 ctrl 100 SNP 100,000 とすると 100,000 * 200 のgenotypeがある。アレルを表すなら、3種類の文字があればよい文字と区切り(\…

2012-10-12

咳嗽(担当YM)

医学 CaseStudy

主訴：咳嗽 33F 7日前体熱感 5日前咳嗽 OTC(イブプロフェン)、のど飴、氷枕で様子見しつつ出勤症状は徐々に悪化本日改善せず外来受診鑑別診断細菌性肺炎非定型肺炎抗酸菌性肺炎結核喘息かぜ気管支拡張症過敏性肺臓炎間質性肺炎 ANCA関連肺炎 …

2012-10-11

倦怠感・食思不振・confusion(担当AY)

医学 CaseStudy

80歳男性倦怠感、食思不振、confusion 家族に連れられて来院意識清明、従命可 BP160/80mmHg、88bpm 整、16/min 発熱なし脳神経異常(-) 頸部リンパ節腫脹(-) 黄疸(-) 心：心雑音(-) 胸：ラ音(-) 腹部：膨満、軟。雑音(+) 叩打痛(-) 四肢：冷感(-)、浮腫(-)…