LINUX

Mac OSXのRで日本語をプロットしたい

R13.2なのだが、Macでプロットするとき、日本語がたいてい化ける。 テキストエンコーディング?なにそれおいしいの?という情弱っぷりなので、グーグル先生に聞いた。 R、日本語、プロット、なんかでググるとたくさん出てきた。生態学のデータ解析 - R 作図の…

Next Generation Sequencer Analysis for DNA Methylation

次世代シークエンサー(以下、NGS)を使ったメチローム解析をやりたいメモ。 適宜追加する方針だが、まとめがこのページになればいいな。1. はじめに 2. 情報サイト

並列コンピュータ

メモリが激安という話をしていたら教えてもらった話でメモ。 GPGPUプログラミング

ファイル書き出し

cp former.file latter.file # 前に置いてあるファイルを後ろに置いてあるファイルにコピーする。 cat file1 file2 file3 ... > files # 並べたファイルをfilesに書き出す。ワイルドカードと組み合わせたら大量ファイルを扱えそう。

ワイルドカードについて

ワイルドカードというものがあるらしい。 ? 任意の1文字。ただし,ドット・ファイルのドット"."は除く * 0文字以上の文字列。ただし,ドット・ファイルのドット"."は除く [ ] [ ]内の任意の1文字。ハイフン"-"により文字範囲を指定できる { } { }内の任意の…

PythonというかLINUX(なのか?)を始めてみた

バイオインフォマティクスっぽいことを始めるために、PythonとBioPythonを先生から勧められたのだが、なんかファイル操作の練習課題をもらったので、PythonをやっているとなんかLinuxの知識が必要っぽい。 そこで先生やNKのブログをググっていたら、なんかい…